Korzenie imienia Jowita sięgają starożytnego Rzymu, gdzie funkcjonowało jako żeńska forma Jupiter – najważniejszego bóstwa panteonu rzymskiego. Jupiter był utożsamiany z siłami przyrody, burzą, niebem i prawem. Jego łacińska nazwa wywodzi się od rekonstrukcji włoskiego *Djous patēr (dosł. „ojciec nieba”), co łączy się z prajęzykiem indoeuropejskim.
W chrześcijaństwie imię zyskało nowy wymiar przez kult świętej Jowity, pochodzącej z rodziny arystokratycznej w Akwilei. Według podań wraz z bratem Wilibaldem przyjęła wiarę chrześcijańską i poniosła męczeńską śmierć około III wieku. Jej relikwie były czczone w zachodnich regionach Cesarstwa Rzymskiego, co przyczyniło się do rozprzestrzenienia imienia. W okresie średniowiecza Jowita funkcjonowała przede wszystkim w kronikach kościelnych i aktach parafialnych Włoch, Francji i Niemiec.
Do Polski imię trafiło najprawdopodobniej dzięki kontaktom z zakonem benedyktynów oraz przez pielgrzymów odwiedzających groby świętych. Pierwsze wzmianki w naszych rejestrach datowane są na XIV wiek, natomiast renesansowy boom nadawał mu odcień elegancji i klasycyzmu. W czasach nowożytnych Jowita utrzymywała stałą, choć niewielką popularność. W XX wieku pojawiła się w literaturze pięknej i publicystyce, zyskując sympatyków jako imię wyjątkowe i melodyjne.